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殷开山、刘弘基屯扎在长安故城。太宗率军亲自奔赴司竹，贼酋李仲文、何潘仁、向善志等人都率兵来会合，屯兵在阿城，获得兵士十三万。长安父老拿牛、酒到军门的很多，太宗慰劳他们而后送走他们，什么也不接受。军令严明整肃，秋毫无犯。不久太宗与大军平定京城。高祖辅助国政，任唐国内史，改封为秦国公。恰值薛举精兵十万前来逼近渭水之滨，太宗亲自攻打，大破其部众，追杀一万多人，攻占敌军土地一直到陇坻。
义宁元年(617)十二月，太宗再次被任命为右元帅，统兵十万攻取东都。等到将要回军时，对左右的人道“：贼人见我回军，必定会相继跟踪追击。”设下三次埋伏以等待追兵。不久，隋将段达率领一万多人从后追到，过三王陵时，太宗发动伏兵攻击，段达大败，追杀敌军直到城下。于是在宜阳、新安设置熊、谷二州，派人留守而回。迁徙改封太宗为赵国公。高祖即皇帝位，任命太宗为尚书令、右武侯大将军，晋封秦王，加授为雍州牧。
武德元年(618)七月，薛举入侵泾州，太宗率众军加以讨伐，不胜而回。九月，薛举死，其子仁杲继立。太宗又被任命为元帅攻击仁杲，两军在折土庶城相持不下，双方挖深沟筑起高高营垒相持六十多天。贼众十多万，军队的气势强盛，多次前来挑战，太宗按兵不动以挫败他的锐势。贼人粮食已完，贼将牟君才、梁胡郎前来投降。太宗对诸将军道“：敌军锐气丧失衰退了，我军当攻取他们。”派将军庞玉先在浅水原南扎阵以引诱贼人，贼将宗罗日侯集中军队前来抗击，庞玉军几乎失败。不久太宗亲统大军出其不意覆盖了浅水原北。宗罗日侯远远望见，再次回军抗拒。太宗率领精锐骑兵数十人攻入贼阵，于是太宗之军里外配合一齐奋力攻击，罗日侯全军溃败，太宗斩贼首级数千个，掉入山涧山谷而死者不可胜计。太宗率领随从二十多个骑兵追赶逃跑敌军，笔直奔赴折土庶而追逐敌军。仁杲十分恐惧，环城守卫。将晚，太宗大军陆续到来，四面合围。早晨，仁杲请降，太宗俘虏他的精兵一万余人，男女五万口。
不久诸将祝贺，因趁机问道：“刚开始大王野战攻破贼人，贼酋还保有坚固城池，而大王没有攻战之器具，用轻骑兵转战追逐，不等待步兵，直接迫于敌人城下，都怀疑不能战胜，然而竟然攻下了，这是什么缘故？”太宗道“：这是用权宜之计逼迫他，使他们的计谋没有机会发出，因为这个原因战胜。罗日侯依靠往年取胜，加之长期养足了锐气，见我军不出，心中对我轻视。现在敌军见我出战，十分高兴，全部军队前来作战，虽然我已击破他，但擒捉杀掉的还少。假若不急速追逐，敌军回军投入折土庶城，仁杲收拢安抚，那就不可能战胜了。再说敌军兵众都是陇西人，战败逃散，来不及回顾，败逃到陇外，则折土庶城自然空虚，我军随后压下，所以恐惧而投降。这些可谓是已定的计划，诸君难道全部不见吗？”诸将道“：这不是普通人所能赶得上的。”获得贼兵精锐骑兵很多，仍令仁杲兄弟及贼帅宗罗日侯、翟长孙等率领。太宗与他们游乐骑射，没有什么距离隔阂。投降的贼徒感恩并慑于太宗的威势，都愿意以死报效。当时李密刚刚归附，高祖命令李密骑驿马到豳州迎太宗。李密见太宗天姿英明威武，军威严肃，悚惧叹服，私下对殷开山道“：真是英明之主也。不是这样，凭什么来平定祸乱呢？”太宗凯旋，在太庙献捷。任命太宗为太尉、陕东道行台尚书令，镇守长春宫，关东兵马全部受他节制调度。不久又加授左武侯大将军、凉州总管。
宋金刚攻陷浍州，军队气势强盛。高祖因为王行本还占据蒲州，吕崇茂在夏县反叛，晋、浍二州接着陷落，关中震动惊骇，于是下手令道：“贼人气势像这样厉害，难以与他们争胜负，应该抛弃河东之地，只好好守住关西罢了。”太宗上表道“：太原是王业的基础，国家的根本，河东富裕是京城的凭借。假若全部抛弃，臣私下感到憋闷遗憾。希望借助臣精兵三万，必定能消灭平定刘武周，克复汾、晋。”高祖于是全部调遣关中兵加给太宗，又亲自驾临长春宫送太宗。
二年(619)十一月，太宗率军队奔赴龙门关，踏冰而渡过黄河，进驻柏壁，与贼将宋金刚对峙。不久永安王孝基在夏县被打败，于筠、独孤怀恩、唐俭都被贼将寻相、尉迟敬德所俘，将要回到浍州去。太宗派殷开山、秦叔宝在美良川拦截，大破贼军，寻相等人仅仅本人逃脱，太宗全部俘虏他的部众，再回柏壁。于是众将都请战，太宗道：“金刚是奔走千里的孤军，深入我地，精兵强将，都在这里。刘武周占据太原，专门依靠宋金刚来抵抗。士卒虽多，内面实际很空虚，意在速战。我巩固营垒，养精蓄锐以挫折他的锋芒，贼粮尽计穷，自当逃跑。”
三年(620)二月，宋金刚终于因为军众饥饿而逃遁，太宗率军直追到介州。宋金刚排列军阵，南北七里长，以抗拒官军。太宗派总管李世责力、程咬金、秦叔宝抵挡宋金刚的北面军队，翟长孙、秦武通抗击宋金刚南面的军队。诸军战斗稍稍退却，被贼兵所战胜。太宗率精锐骑兵攻击他，冲击他行阵的后部，贼众大败，追打数十里。敬德、寻相率领残部八千人来归降，仍旧命敬德统率，与太宗军营混在一起，屈突通害怕尉迟敬德发生叛变，迅速以此向太宗请求不要让尉迟敬德率兵。太宗道“：过去萧王对人推心置腹，都能尽力效命，现在委任敬德，又何必疑惧。”这时刘武周奔到突厥，并、汾二州又全部恢复了旧地，高祖诏命就在军中加拜太宗为益州道行台尚书令。
七月，太宗统率各军在洛邑攻打王世充，军队驻扎在谷州。世充率精兵三万在慈涧扎阵，太宗用轻骑兵引逗他。当时众寡不敌，太宗陷入重围，左右的人都恐惧。太宗命令左右的人先行归营，独自一人率军在最后。世充的勇将单雄信数百骑兵夹道进逼，争先进攻，太宗几乎被他打败。太宗张弓箭左右射敌，贼众没有一个不是应弦而倒，俘虏了世充的大将燕颀。世充于是将慈涧之兵改移回到东都。太宗派行军总管史万宝从宜阳往南占据龙门，刘德威从太行往东包围河内，王君廓从洛口斩断贼军运粮通道。又派黄君汉连夜从孝水河中下舟船偷袭回洛城，攻克了回洛城。黄河以南，没有一个地方不响应，城堡一个接一个前来归降。大军进驻邙山。九月，太宗用五百骑兵先行观察战场地势，终于与王世充一万多人相遇，两军交战，太宗再次攻破了他，斩首级三千个，俘虏了大将陈智略，世充仅仅本人逃脱。他所部署的筠州总管杨庆派使者请求归降，太宗派李世责力率军从頧辕道出去安抚杨庆的部众。荥、汴、洧、豫九州一个一个前来归降。世充于是向窦建德求救。
武德四年(621)二月，太宗又进驻青城宫。太宗营垒尚未建立，世充之军队二万人从方诸门面临谷水扎阵。太宗以精锐骑兵在北邙山扎阵，令屈突通率五千步兵渡水攻击王世充，并趁机告诫通道“：等到双方交战时就放烟，我当率骑兵南下。”双方军队才接战，太宗用骑兵冲锋，自己挺身冲锋在前，与屈突通里外呼应。贼众拼死作战，多次打散又多次聚合。从早晨七点至九点一直战到下午一点，贼众才开始退却。太宗指挥兵士追击，俘获、斩首共八千人，于是进兵屯营到城下。世充不敢再出战，只是环城自守，以等待窦建德救援。太宗派遣诸军挖掘壕沟，环绕布置长期围守。吴王杜伏威派遣他的大将陈正通、徐召宗率精兵二千人前来在太宗军营会合。伪郑州司马沈悦以武牢来投降，将军王君廓响应，活捉伪荆王王行本。
恰巧窦建德率兵十余万来援救王世充，到达酸枣。萧王禹、屈突通、封德彝都因为腹背受敌，恐怕不是万全之策，请求退师到谷州来观看形势。太宗道“：世充粮食已尽，内外离心，我军不需攻击，可以坐收敌军破败之功。建德新近攻破孟海公，将官骄傲士兵怠惰，我军当进攻占据武关，扼守山川要冲。贼假若与我军争胜负，我攻破贼军是必然的了。如果不战，十日之间世充当会自我崩溃。若不急速进攻，贼军进入武牢，诸城刚刚归附，必定不能坚守。二贼力量合并，将能把他们怎么办呢？”屈突通又请求解围到险要之处以等候敌军内部生变，太宗不同意。于是留屈突通辅助齐王元吉以包围王世充，亲自率领骑兵三千五百人奔赴武牢。
窦建德从荥阳西上，筑营垒在板渚，太宗驻军在武牢，两军对峙二十多天。探听消息的人报告道“：建德探听官军牲畜的饲料已尽，等候在黄河北岸放马吃草时，趁机偷袭武牢。”太宗知道他们的阴谋，于是放马在黄河北岸吃草来诱敌。早晨，建德果然率全部兵马到来，陈列军队在汜水之上，世充大将郭士衡扎阵在南面，绵延数里，呐喊，诸将大为恐惧。太宗率几名骑兵登上高高土丘遥望敌军，对诸将道：“贼人起兵山东，没有遇见过强大的敌人。现在渡过险要之处而叫嚣，这是没有政令的表现；逼近城墙扎阵，有轻视我们的思想。我按兵不出，敌军气势便衰竭，扎阵太久士卒饥饿，必将自我撤退，这时再来追击，可以无往而不胜。我与你们约定，必定在午时以后攻破敌军。”建德排出阵势，从上午七点直到下午一点，兵士又饿又累，都坐在阵列中，又争着饮水，顷刻间又收敛退却。太宗道“：可以攻击了！”亲自率领轻装的骑兵追击引诱敌军，大军陆续赶到。建德回军扎阵，还来不及整顿阵列，太宗先行攻击，攻击所向，敌军纷纷溃散。不久，众军会合作战，尘土飞扬，呼叫四起。太宗率史大奈、程咬金、秦叔宝、宇文歆等挥动大旗冲入，直接突入到阵后，张挂我军旗帜。贼人回头看见官军旗帜，全军崩溃。追逐攻打三十里，斩首级三千多个，俘虏贼众五万，在阵中活捉窦建德。太宗责备他道：“我兴师问罪，本在王世充，得失存亡，不干你事，为什么越过边境，冒犯我军锋锐？”建德恐惧，两腿发抖说“：现在我假若不来，怕麻烦你远远地攻取我！”高祖听后大喜，亲手写诏书道：“隋朝分崩，崤山、函谷关隔绝。两雄会合，一朝清平。军队已经获胜，更没有死伤。做臣子的不惭愧，做君父的不担忧，都是你的功劳。”
于是带建德到东都城下。王世充恐惧，统率他的官属二千多人到军门请求归降，山东全部平定。太宗进入占据宫城，令萧王禹、窦轨等人封存守卫府库，什么东西都不取，只令记室房玄龄收取隋朝地图与户籍。于是杀了共同作恶的段达等五十多人，冤枉被囚禁者全部释放，无罪而被杀者加以祭祀并写祭文致以哀悼。用酒食大大款待将士，按品级等第颁赐物品。高祖令尚书左仆射裴寂在军中慰劳。
六月，凯旋。太宗亲自披挂黄金铠甲，排列铁马一万骑兵，穿铠甲士兵三万人，前后部都敲鼓吹号，在太庙贡献俘虏的二伪主窦建德、王世充以及隋朝器物车乘。高祖认为自古以来旧的官阶与特殊功劳不相称，于是另外发徽号，以表彰功勋德望。十月，加太宗天策上将封号、陕东道大行台，位在王公之上。增加食邑二万户，连以前的共计三万户。赐给金车一辆，王公之衮衣和冠冕一套，玉璧一双，黄金六十斤，前后部鼓吹及九部之乐，仪仗四十人。
这时海内渐渐太平，太宗于是专心一意读图书经籍，开文学馆以接待四方才学之士。行台司勋郎中杜如晦等十八人为学士，每次在阁下轮流值班，太宗则降低身份以温和态度与学士们讨论经义，有时谈论到半夜才结束。
不久，窦建德旧将刘黑闼举兵造反，占据氵名州。十二月，太宗总统全军向东去讨伐他。五年(622)正月，进军肥乡，分兵断绝他运粮的通道，双方对峙两个月。刘黑闼被胁迫急于求战，率领步兵、骑兵二万人，南渡氵名水，早晨便迫近官军。太宗亲自率领精锐骑兵，攻击他的骑兵，攻破了他，乘胜冲击践踏他的步兵，贼兵崩溃，斩首级一万多个。先前太宗派人筑坝堵塞氵名水上流使水流变浅，让刘黑闼得已渡水。等到作战之时，才命令挖开拦河坝，大水冲到，一丈多深，贼兵已经战败，逃到水中都淹死了。刘黑闼与二百多骑兵往北逃到突厥，太宗全部俘虏了刘黑闼的部众，河北平定。当时徐圆朗带兵在徐、兖二州阻碍太宗，太宗这时便回师讨伐平定了徐圆朗，于是河、济、江、淮所有州郡城镇都平定。十月，加授太宗左右十二卫大将军。
七年(624)秋，突厥颉利、突利两个可汗王从原州入侵，侵略扰乱关中。有人说服高祖道“：只因为府藏子女金帛在京都，故而突厥前来入侵，假若烧掉长安而不建为都城，那么胡人自必停止入侵。”高祖于是派遣中书侍郎宇文士及巡行山南可以居住的好地方，即想迁移京都。萧王禹等人都认为不妥当，然而终究不敢冒犯高祖的威严而直言劝谏。惟独太宗道“：霍去病，是汉朝的将帅啊，还立志消灭匈奴。臣惭愧位列封王，尚且使胡人入侵不止，竟然令皇上议论想要迁都，这是我做臣下的责任。希望皇上听任臣报效一次微劳，攻取那个颉利。假若一两年内不将他捉住，慢慢商议迁都的策略，臣再不敢重说反对迁都。”高祖愤怒，仍旧派遣太宗率领三十多个骑兵巡行关中拟定铲平敌人之计划。太宗回军之日，坚决奏请不可迁都，高祖于是停止迁都。八年(625)，加太宗中书令。
九年(626)，皇太子建成、齐王元吉谋害太宗。六月四日，太宗率长孙无忌、尉迟敬德、房玄龄、杜如晦、宇文士及、高士廉、侯君集、程知节、秦叔宝、段志玄、屈突通、张士贵等在玄武门杀了建成、元吉。六月八日，太宗被立为皇太子，各种政务皆由太宗决断。太宗于是放掉宫廷花园中所养的鹰犬，并停止收取各方所进贡的奇珍异宝，政理崇尚简要严肃，天下人大喜。又命令百官各个呈上封章奏事，详细陈述安定人心治国的关键。十三日，命令道：“依照礼法，皇帝的两个名字不要为某一个字而避讳。近代以来，两个名字都避讳，废缺地方已经很多，任意避讳，有违经典。那些官号、人名、公私文籍图书，有‘世民’两个字不连续的，并不须要避讳。”撤销幽州大都督府。十五日，废除陕东道大行台，设置氵名州都督府；废除益州道行台，设置益州大都督府。二十六日，幽州大都督庐江王瑗图谋叛逆，废弃他为普通百姓。二十九日，撤销天策府。
七月六日，太子左庶子高士廉任侍中，右庶子房玄龄任中书令，尚书右仆射萧王禹为尚书左仆射，吏部尚书杨恭仁为雍州牧，太子左庶子长孙无忌为吏部尚书，右庶子杜如晦为兵部尚书，太子詹事宇文士及为中书令，封德彝为尚书右仆射。
八月八日，高祖传位给皇太子，太宗在东宫显德殿即位。派司空、魏国公裴寂在南郊烧柴祭天。大赦天下，武德元年(618)以来由于直言被责罚流放的人都放回来。文武官员五品以上先前无爵位者赐给爵位一级，六品以下加勋级一等。天下免赋税徭役一年。十八日，放宫廷宫女三千人回家。十九日，突厥颉利、突利入侵泾州。二十日，突厥入侵武功，京师戒严。二十一日，立妃子长孙氏为皇后。二十四日，突厥入侵高陵。二十六日，行军总管尉迟敬德与突厥在泾阳大战，大破突厥，斩首级一千多个。二十八日，突厥颉利到达渭水边，与颉利隔渭水对话，斥责他背弃定约。不久大军陆续到达，颉利见军容盛大威严，又知道执失思力被捕，由此大为恐惧，于是请求和解，诏令同意。太宗当天回宫。三十日，太宗又驾到便桥，与颉利杀白马而设盟誓，突厥带兵退走。
九月一日，颉利献马三千匹，羊一万口，太宗不受，命令颉利归还掳掠的中国人口。二十二日，太宗率领所有禁军步骑将领在显德殿殿廷学习射箭，对将军及其以下的官员说：“从古以来，突厥与中国互有盛衰。像轩辕善于使用五种兵器，就能北逐獯鬻；周宣王在方、召驱马驰骋，也能在太原取胜。到了汉、晋之君王，直到隋代，不让兵士平素练习干戈等兵器，突厥来侵犯，没有人能够抵御，致使中国百姓在敌寇手中处于极端困苦的处境。我现在不让你们挖池塘筑花园，建造所有过分糜费的东西，不让农民放纵安逸享乐，兵士只练习射箭骑马，期望使你们能够战斗，也期望你们前面没有强敌。”于是每天率领数百人在殿前教他们射箭，皇帝亲自面试，射中者随即赏赐弓刀、布匹绸缎。朝中有很多劝谏的臣子，他们说：“先王制度法令，有拿武器到皇帝处所的人处以刑法，用来在坏事尚未发生前就加以防止，这是防备意料不到的事。现在率领副将士卒一类的人，在皇宫殿前檐下平台及台阶上弯弓放箭，皇帝陛下却在旁边，正恐怕祸出意外，这不是用来为国家考虑的做法。”皇上不采纳。从此以后，士兵都成精锐部队。二十七日，诏令私人之家，不得擅权建立妖神，随意设立不适当的祭祀，不合礼法的祭祀祈祷，一概禁绝。除了龟甲兽骨五种占卜以外，其他杂七杂八的占卦卜卦，也都停止断绝使用。长孙无忌封为齐国公，房玄龄封为邢国公，尉迟敬德封为吴国公，杜如晦封为蔡国公，侯君集封为潞国公。
冬十一月一日，是朔日，有日蚀。八日，立中山王承乾为皇太子。十八日，裴寂食实际封户一千五百户。长孙无忌、王君廓、尉迟敬德、房玄龄、杜如晦食实封一千三百户。长孙顺德、柴绍、罗艺、赵郡王孝恭食实封一千二百户。侯君集、张公瑾、刘师立食实封一千户。李世责力、刘弘基食实封九百户。高士廉、宇文士及、秦叔宝、程知节食实封七百户。安兴贵、安修仁、唐俭、窦轨、屈突通、萧王禹、封德彝、刘义节食实封六百户。钱九陇、樊世兴、公孙武达、李孟常、段志玄、庞卿恽、张亮、李药师、杜淹、元仲文食实封四百户。张长逊、张平高、李安远、李子和、秦行师、马三宝食实封三百户。
十一月五日，宗室封为郡王者一律降封为县公。
十二月十九日，皇上亲自审查并记录囚徒罪状。
这一年，新罗、龟兹、突厥、高丽、百济、党项都派遣使者前来朝贡。
贞观元年(627)春正月一日，改元。十七日，燕郡王李艺占据泾州造反，不久被左右的人所杀，传送首级到京师示众。以仆射窦轨为益州大都督。
三月十日，皇后亲自养蚕。尚书左仆射、宋国公萧王禹为太子少师。二十三日，皇上下诏：“齐已故尚书仆射崔季舒、给事黄门侍郎郭遵、尚书右丞封孝琰等人，过去在邺中做官，名位显贵，心存忠诚正直，上表抗争极谏，设法挽救国家的危亡，却遭到像关龙逢一样的被囚禁杀害的酷刑。崔季舒之子崔刚、郭遵之子郭云、封孝琰之子封君遵，都因为家门遭到灾祸，高氏滥用刑法而受到株连。应该表扬奖励，特别与一般伦常关系不同，可以免除在宫廷侍候，而量才录用，另外议定官职。”
夏四月十二日，凉州都督、长乐王幼良被判死刑。
六月一日，尚书右仆射、密国公封德彝去世。十二日，太子少师宋国公萧王禹为尚书右仆射。
这年夏天，山东各州大旱灾，命令所在地赈济抚恤，不出今年田租赋税。
秋七月二日，吏部尚书、齐国公长孙无忌为尚书右仆射。
八月十九日，贬侍中、义兴郡公高士廉为安州大都督。户部尚书裴矩去世。这年，关东及河南陇右沿边疆各州遭霜危害秋季庄稼。
九月十二日，命中书侍郎温彦博、尚书右丞魏征等分头到各州赈济抚恤。中书令、郢国公宇文士及任殿中监。御史大夫、检校吏部尚书、参预朝政、安吉郡公杜淹可于姓名前加书官衔。
十二月四日，皇上对侍臣道：“神仙之事本虚假不实，空有其名。秦始皇特别爱好，于是被讲神仙方术的人所欺诈，竟派遣童男童女数千人随徐福入海求仙药，方术之士躲避秦朝严酷刑法，因而留海外不归。秦始皇还在海边徘徊等待仙药，回来到沙丘而病死。汉武帝为求仙，竟将女儿嫁给道术之人，事情既然无验证，便将道术之士杀掉。根据这两件事，神仙不须多加妄求。”尚书左仆射、宋国公萧王禹犯法免职。三十日，利州都督义安王孝常、右武卫将军刘德裕等人谋反，被判死刑。
这年，关中是荒年，以至于有卖儿女的。
贞观二年(628)春正月，尚书右仆射、齐国公长孙无忌为开府仪同三司。迁移改封汉王恪为蜀王，卫王泰为越王，楚王。。为燕王。再次设置六侍郎，副六尚书事，并设置左右司郎中各一人。前安州大都督、赵王元景为雍州牧，蜀王恪为益州大都督，越王泰为扬州大都督。
二月九日，。归附。
三月一日，是朔日，有日蚀。二十日，派遣御史大夫杜淹巡视关内各州。拿出后宫金银宝器，把出卖自己的男女赎还给他们的父母。二十三日，大赦天下。
夏四月三日，诏令凡是暴露的尸骨，命令所在地埋葬。二十日，契丹归附。首次诏令天下州县都设置义仓。夏州贼酋梁师都被其堂弟洛仁所杀，率城池归降。
五月，下大冰雹。
六月十五日，皇子李治出生，宴请五品以上官员，按品级等第赐给绸缎，又赏赐天下这一天出生的人以粟米。十六日，皇上对侍臣道：“君王即使不像君王，臣子不可以不像臣子。裴虔通是隋炀帝的左右侍从之臣，然而他亲自成为祸乱之首。朕正崇尚奖励忠孝仁义，岂可以仍使百姓顺应这种风俗。”诏命道“：天地定下君臣之位，君臣之道义因此表明；高低的地位既然已经陈述，人伦之道这才明确。因此风俗淳厚，教化天下。即使时常经过治和乱，君主有的昏庸有的英明，但疾风知劲草，留芳千古的忠臣不会断绝，剖心焚体，视死如归。难道他们不爱惜自己七尺之躯，不重视自己的性命？谅必是由于君臣义重，等级名分和礼教在前，故能在当时明白大节，在身后树立清名。至于赵高杀害秦二世，董卓鸩杀弘农王，人神所痛恨，不同朝代共同愤恨。况且凡庸俗小人，胸怀凶狠叛逆，闲暇时观看典籍，没有一个人不被诛杀。辰州刺史、长蛇县男裴虔通，过去在隋代，曾寄身于晋王手下，炀帝由于老臣之情，特加喜爱宠信。终于心无君上，暗中图谋杀害皇帝，窥探时机，招集一些叛逆，长矛飞箭，一朝暗中发动。天下之大恶如此，谁能加以容忍！本应消灭他的宗族，焚烧他的首级，以死刑向天下表明。但由于年代不同，累次遇到大赦之令，可以特别免除死刑，削除官职爵位，发配充军到。。州。”
秋七月四日，诏曰：“莱州刺史牛方裕、绛州刺史薛世良、广州都督府长史唐奉义、隋武牙郎将高元礼，都在隋朝受到重用，竟然勾结宇文化及，构成谋杀帝王之罪。应该依照处理裴虔通之法，削除官职爵位，发配充军到岭表。”太宗对侍奉之臣说“：天下愚昧之人，喜欢犯法，凡是大赦宽免的恩德，只是施及到遵守法律的人身上。古话说：‘小人的幸运，是君子的不幸。’‘一年赦免两次，好人会从此不再说话。’凡是培育恶草者伤害庄稼，给予犯法作乱的人以恩惠是危害好人。过去文王作刑法，施刑而不赦免。另外蜀先主刘备曾经对诸葛亮说‘：我在陈元方、郑康成之间交际应酬，常见他们谈及文启文告治与乱的办法很详备了，从不谈及大赦之事。’小人，是大人的危害，所以朕据有天下以来，不大发布大赦。现在四海平定，礼义兴起施行，特别的恩德，不可多次施行，如果多发布大赦，恐怕愚昧之人将会常常希望侥幸大赦，只想犯法，不能改过。”
八月一日，是朔日，皇上驾到朝堂，亲自鉴察冤屈。从此，皇上认为军国无事，每天到西宫侍候父母吃饭。二十日，公卿奏道“：依照礼制，夏季，皇上可以居住在台榭。现在盛暑未退，秋雨连绵开始，宫中低下潮湿，请兴建一个楼阁来居住。”皇上道：“朕有湿气之病，难道适宜住在低下潮湿之处。但假若同意公卿兴建楼阁的请求，耗费太多。过去汉文帝将兴建承露台，然而爱惜建台乃十家的产业而作罢。朕的德行不及汉文帝，然而所耗的费用超过了他，难道能说这是做人民父母的思想吗？”终究不允许。这月，河南、河北大霜冻，人们遭遇大饥荒。
九月四日，皇上对侍臣道：“妇人关闭在深宫，情况实在可怜。隋朝末年，采求宫女不止，至于离宫别馆，不是皇帝驾到之地，多多聚集宫人妇女，都竭尽了人力财力，是朕所不取的。再说她们除洒扫宫庭之外，还有什么用处？现在将她们放出，任凭她们选择配偶，这不仅仅是怕浪费，也是让这些妇女满足各人的性格追求。”于是派尚书左丞戴胄、给事中杜正伦等，在掖庭宫西门挑选后遣送出去。
冬十月七日，御史大夫、安吉郡公杜淹去世。十五日，杀瀛州刺史卢祖尚。
十一月十九日，在圆丘有事。
十二月十日，黄门侍郎王王圭为侍中。
三年(629)春正月九日，契丹大帅来朝见。十六日，晋谒太庙。二十一日，皇上亲自耕种征用民用耕种的田。二十九日，司空、魏国公裴寂犯法免官。
二月六日，中书令、邢国公房玄龄为尚书左仆射，兵部尚书、检校侍中、蔡国公杜如晦为尚书右仆射，刑部尚书、检校中书令、永康县公李靖为兵部尚书，尚书右丞魏征试用为秘书监，参预朝政。
夏四月十日，太上皇迁居大安宫。二十三日，太宗开始在太极殿听政。
五月，周王元方去世。
六月八日，因为干旱，皇上亲自审查并记录囚徒罪状。派遣长孙无忌、房玄龄等人在名山大川求雨，中书舍人杜正伦等人往关内各州安抚慰问。又命令文武官员各人上密封的奏章，尽量说出朝政得失。九日，大风吹断了树木。秋八月一日，是朔日，有日蚀。薛延陀派使者前来朝贡。
九月十六日，各州设置医学。
冬十一月九日，西突厥、高昌派使者前来朝贡。二十二日，以并州都督李世责力为通汉道行军总管，兵部尚书李靖为定襄道行军总管，以打击突厥。
十二月二日，突利可汗奔来归附。十七日，杜如晦因病辞去官位，太宗同意。闰十二月十七日，诏令建立义军以来交兵之处，替义士勇夫在阵战中牺牲者各建立一座寺庙。命令虞世南、李伯药、褚亮、颜师古、岑文本、许敬宗、朱子奢等人为他们立碑刻铭文，以记载他们的功业。
这年，户部奏称：中国人从塞外归来及突厥前前后后归附、开辟四边少数民族地区为州县的地方，男女有一百二十余万人口。
殷开山、刘弘基屯扎在长安故城。太宗率军亲自奔赴司竹，贼酋李仲文、何潘仁、向善志等人都率兵来会合，屯兵在阿城，获得兵士十三万。长安父老拿牛、酒到军门的很多，太宗慰劳他们而后送走他们，什么也不接受。军令严明整肃，秋毫无犯。不久太宗与大军平定京城。高祖辅助国政，任唐国内史，改封为秦国公。恰值薛举精兵十万前来逼近渭水之滨，太宗亲自攻打，大破其部众，追杀一万多人，攻占敌军土地一直到陇坻。
义宁元年(617)十二月，太宗再次被任命为右元帅，统兵十万攻取东都。等到将要回军时，对左右的人道“：贼人见我回军，必定会相继跟踪追击。”设下三次埋伏以等待追兵。不久，隋将段达率领一万多人从后追到，过三王陵时，太宗发动伏兵攻击，段达大败，追杀敌军直到城下。于是在宜阳、新安设置熊、谷二州，派人留守而回。迁徙改封太宗为赵国公。高祖即皇帝位，任命太宗为尚书令、右武侯大将军，晋封秦王，加授为雍州牧。
武德元年(618)七月，薛举入侵泾州，太宗率众军加以讨伐，不胜而回。九月，薛举死，其子仁杲继立。太宗又被任命为元帅攻击仁杲，两军在折土庶城相持不下，双方挖深沟筑起高高营垒相持六十多天。贼众十多万，军队的气势强盛，多次前来挑战，太宗按兵不动以挫败他的锐势。贼人粮食已完，贼将牟君才、梁胡郎前来投降。太宗对诸将军道“：敌军锐气丧失衰退了，我军当攻取他们。”派将军庞玉先在浅水原南扎阵以引诱贼人，贼将宗罗日侯集中军队前来抗击，庞玉军几乎失败。不久太宗亲统大军出其不意覆盖了浅水原北。宗罗日侯远远望见，再次回军抗拒。太宗率领精锐骑兵数十人攻入贼阵，于是太宗之军里外配合一齐奋力攻击，罗日侯全军溃败，太宗斩贼首级数千个，掉入山涧山谷而死者不可胜计。太宗率领随从二十多个骑兵追赶逃跑敌军，笔直奔赴折土庶而追逐敌军。仁杲十分恐惧，环城守卫。将晚，太宗大军陆续到来，四面合围。早晨，仁杲请降，太宗俘虏他的精兵一万余人，男女五万口。
不久诸将祝贺，因趁机问道：“刚开始大王野战攻破贼人，贼酋还保有坚固城池，而大王没有攻战之器具，用轻骑兵转战追逐，不等待步兵，直接迫于敌人城下，都怀疑不能战胜，然而竟然攻下了，这是什么缘故？”太宗道“：这是用权宜之计逼迫他，使他们的计谋没有机会发出，因为这个原因战胜。罗日侯依靠往年取胜，加之长期养足了锐气，见我军不出，心中对我轻视。现在敌军见我出战，十分高兴，全部军队前来作战，虽然我已击破他，但擒捉杀掉的还少。假若不急速追逐，敌军回军投入折土庶城，仁杲收拢安抚，那就不可能战胜了。再说敌军兵众都是陇西人，战败逃散，来不及回顾，败逃到陇外，则折土庶城自然空虚，我军随后压下，所以恐惧而投降。这些可谓是已定的计划，诸君难道全部不见吗？”诸将道“：这不是普通人所能赶得上的。”获得贼兵精锐骑兵很多，仍令仁杲兄弟及贼帅宗罗日侯、翟长孙等率领。太宗与他们游乐骑射，没有什么距离隔阂。投降的贼徒感恩并慑于太宗的威势，都愿意以死报效。当时李密刚刚归附，高祖命令李密骑驿马到豳州迎太宗。李密见太宗天姿英明威武，军威严肃，悚惧叹服，私下对殷开山道“：真是英明之主也。不是这样，凭什么来平定祸乱呢？”太宗凯旋，在太庙献捷。任命太宗为太尉、陕东道行台尚书令，镇守长春宫，关东兵马全部受他节制调度。不久又加授左武侯大将军、凉州总管。
宋金刚攻陷浍州，军队气势强盛。高祖因为王行本还占据蒲州，吕崇茂在夏县反叛，晋、浍二州接着陷落，关中震动惊骇，于是下手令道：“贼人气势像这样厉害，难以与他们争胜负，应该抛弃河东之地，只好好守住关西罢了。”太宗上表道“：太原是王业的基础，国家的根本，河东富裕是京城的凭借。假若全部抛弃，臣私下感到憋闷遗憾。希望借助臣精兵三万，必定能消灭平定刘武周，克复汾、晋。”高祖于是全部调遣关中兵加给太宗，又亲自驾临长春宫送太宗。
二年(619)十一月，太宗率军队奔赴龙门关，踏冰而渡过黄河，进驻柏壁，与贼将宋金刚对峙。不久永安王孝基在夏县被打败，于筠、独孤怀恩、唐俭都被贼将寻相、尉迟敬德所俘，将要回到浍州去。太宗派殷开山、秦叔宝在美良川拦截，大破贼军，寻相等人仅仅本人逃脱，太宗全部俘虏他的部众，再回柏壁。于是众将都请战，太宗道：“金刚是奔走千里的孤军，深入我地，精兵强将，都在这里。刘武周占据太原，专门依靠宋金刚来抵抗。士卒虽多，内面实际很空虚，意在速战。我巩固营垒，养精蓄锐以挫折他的锋芒，贼粮尽计穷，自当逃跑。”
三年(620)二月，宋金刚终于因为军众饥饿而逃遁，太宗率军直追到介州。宋金刚排列军阵，南北七里长，以抗拒官军。太宗派总管李世责力、程咬金、秦叔宝抵挡宋金刚的北面军队，翟长孙、秦武通抗击宋金刚南面的军队。诸军战斗稍稍退却，被贼兵所战胜。太宗率精锐骑兵攻击他，冲击他行阵的后部，贼众大败，追打数十里。敬德、寻相率领残部八千人来归降，仍旧命敬德统率，与太宗军营混在一起，屈突通害怕尉迟敬德发生叛变，迅速以此向太宗请求不要让尉迟敬德率兵。太宗道“：过去萧王对人推心置腹，都能尽力效命，现在委任敬德，又何必疑惧。”这时刘武周奔到突厥，并、汾二州又全部恢复了旧地，高祖诏命就在军中加拜太宗为益州道行台尚书令。
七月，太宗统率各军在洛邑攻打王世充，军队驻扎在谷州。世充率精兵三万在慈涧扎阵，太宗用轻骑兵引逗他。当时众寡不敌，太宗陷入重围，左右的人都恐惧。太宗命令左右的人先行归营，独自一人率军在最后。世充的勇将单雄信数百骑兵夹道进逼，争先进攻，太宗几乎被他打败。太宗张弓箭左右射敌，贼众没有一个不是应弦而倒，俘虏了世充的大将燕颀。世充于是将慈涧之兵改移回到东都。太宗派行军总管史万宝从宜阳往南占据龙门，刘德威从太行往东包围河内，王君廓从洛口斩断贼军运粮通道。又派黄君汉连夜从孝水河中下舟船偷袭回洛城，攻克了回洛城。黄河以南，没有一个地方不响应，城堡一个接一个前来归降。大军进驻邙山。九月，太宗用五百骑兵先行观察战场地势，终于与王世充一万多人相遇，两军交战，太宗再次攻破了他，斩首级三千个，俘虏了大将陈智略，世充仅仅本人逃脱。他所部署的筠州总管杨庆派使者请求归降，太宗派李世责力率军从頧辕道出去安抚杨庆的部众。荥、汴、洧、豫九州一个一个前来归降。世充于是向窦建德求救。
武德四年(621)二月，太宗又进驻青城宫。太宗营垒尚未建立，世充之军队二万人从方诸门面临谷水扎阵。太宗以精锐骑兵在北邙山扎阵，令屈突通率五千步兵渡水攻击王世充，并趁机告诫通道“：等到双方交战时就放烟，我当率骑兵南下。”双方军队才接战，太宗用骑兵冲锋，自己挺身冲锋在前，与屈突通里外呼应。贼众拼死作战，多次打散又多次聚合。从早晨七点至九点一直战到下午一点，贼众才开始退却。太宗指挥兵士追击，俘获、斩首共八千人，于是进兵屯营到城下。世充不敢再出战，只是环城自守，以等待窦建德救援。太宗派遣诸军挖掘壕沟，环绕布置长期围守。吴王杜伏威派遣他的大将陈正通、徐召宗率精兵二千人前来在太宗军营会合。伪郑州司马沈悦以武牢来投降，将军王君廓响应，活捉伪荆王王行本。
恰巧窦建德率兵十余万来援救王世充，到达酸枣。萧王禹、屈突通、封德彝都因为腹背受敌，恐怕不是万全之策，请求退师到谷州来观看形势。太宗道“：世充粮食已尽，内外离心，我军不需攻击，可以坐收敌军破败之功。建德新近攻破孟海公，将官骄傲士兵怠惰，我军当进攻占据武关，扼守山川要冲。贼假若与我军争胜负，我攻破贼军是必然的了。如果不战，十日之间世充当会自我崩溃。若不急速进攻，贼军进入武牢，诸城刚刚归附，必定不能坚守。二贼力量合并，将能把他们怎么办呢？”屈突通又请求解围到险要之处以等候敌军内部生变，太宗不同意。于是留屈突通辅助齐王元吉以包围王世充，亲自率领骑兵三千五百人奔赴武牢。
窦建德从荥阳西上，筑营垒在板渚，太宗驻军在武牢，两军对峙二十多天。探听消息的人报告道“：建德探听官军牲畜的饲料已尽，等候在黄河北岸放马吃草时，趁机偷袭武牢。”太宗知道他们的阴谋，于是放马在黄河北岸吃草来诱敌。早晨，建德果然率全部兵马到来，陈列军队在汜水之上，世充大将郭士衡扎阵在南面，绵延数里，呐喊，诸将大为恐惧。太宗率几名骑兵登上高高土丘遥望敌军，对诸将道：“贼人起兵山东，没有遇见过强大的敌人。现在渡过险要之处而叫嚣，这是没有政令的表现；逼近城墙扎阵，有轻视我们的思想。我按兵不出，敌军气势便衰竭，扎阵太久士卒饥饿，必将自我撤退，这时再来追击，可以无往而不胜。我与你们约定，必定在午时以后攻破敌军。”建德排出阵势，从上午七点直到下午一点，兵士又饿又累，都坐在阵列中，又争着饮水，顷刻间又收敛退却。太宗道“：可以攻击了！”亲自率领轻装的骑兵追击引诱敌军，大军陆续赶到。建德回军扎阵，还来不及整顿阵列，太宗先行攻击，攻击所向，敌军纷纷溃散。不久，众军会合作战，尘土飞扬，呼叫四起。太宗率史大奈、程咬金、秦叔宝、宇文歆等挥动大旗冲入，直接突入到阵后，张挂我军旗帜。贼人回头看见官军旗帜，全军崩溃。追逐攻打三十里，斩首级三千多个，俘虏贼众五万，在阵中活捉窦建德。太宗责备他道：“我兴师问罪，本在王世充，得失存亡，不干你事，为什么越过边境，冒犯我军锋锐？”建德恐惧，两腿发抖说“：现在我假若不来，怕麻烦你远远地攻取我！”高祖听后大喜，亲手写诏书道：“隋朝分崩，崤山、函谷关隔绝。两雄会合，一朝清平。军队已经获胜，更没有死伤。做臣子的不惭愧，做君父的不担忧，都是你的功劳。”
于是带建德到东都城下。王世充恐惧，统率他的官属二千多人到军门请求归降，山东全部平定。太宗进入占据宫城，令萧王禹、窦轨等人封存守卫府库，什么东西都不取，只令记室房玄龄收取隋朝地图与户籍。于是杀了共同作恶的段达等五十多人，冤枉被囚禁者全部释放，无罪而被杀者加以祭祀并写祭文致以哀悼。用酒食大大款待将士，按品级等第颁赐物品。高祖令尚书左仆射裴寂在军中慰劳。
六月，凯旋。太宗亲自披挂黄金铠甲，排列铁马一万骑兵，穿铠甲士兵三万人，前后部都敲鼓吹号，在太庙贡献俘虏的二伪主窦建德、王世充以及隋朝器物车乘。高祖认为自古以来旧的官阶与特殊功劳不相称，于是另外发徽号，以表彰功勋德望。十月，加太宗天策上将封号、陕东道大行台，位在王公之上。增加食邑二万户，连以前的共计三万户。赐给金车一辆，王公之衮衣和冠冕一套，玉璧一双，黄金六十斤，前后部鼓吹及九部之乐，仪仗四十人。
这时海内渐渐太平，太宗于是专心一意读图书经籍，开文学馆以接待四方才学之士。行台司勋郎中杜如晦等十八人为学士，每次在阁下轮流值班，太宗则降低身份以温和态度与学士们讨论经义，有时谈论到半夜才结束。
不久，窦建德旧将刘黑闼举兵造反，占据氵名州。十二月，太宗总统全军向东去讨伐他。五年(622)正月，进军肥乡，分兵断绝他运粮的通道，双方对峙两个月。刘黑闼被胁迫急于求战，率领步兵、骑兵二万人，南渡氵名水，早晨便迫近官军。太宗亲自率领精锐骑兵，攻击他的骑兵，攻破了他，乘胜冲击践踏他的步兵，贼兵崩溃，斩首级一万多个。先前太宗派人筑坝堵塞氵名水上流使水流变浅，让刘黑闼得已渡水。等到作战之时，才命令挖开拦河坝，大水冲到，一丈多深，贼兵已经战败，逃到水中都淹死了。刘黑闼与二百多骑兵往北逃到突厥，太宗全部俘虏了刘黑闼的部众，河北平定。当时徐圆朗带兵在徐、兖二州阻碍太宗，太宗这时便回师讨伐平定了徐圆朗，于是河、济、江、淮所有州郡城镇都平定。十月，加授太宗左右十二卫大将军。
七年(624)秋，突厥颉利、突利两个可汗王从原州入侵，侵略扰乱关中。有人说服高祖道“：只因为府藏子女金帛在京都，故而突厥前来入侵，假若烧掉长安而不建为都城，那么胡人自必停止入侵。”高祖于是派遣中书侍郎宇文士及巡行山南可以居住的好地方，即想迁移京都。萧王禹等人都认为不妥当，然而终究不敢冒犯高祖的威严而直言劝谏。惟独太宗道“：霍去病，是汉朝的将帅啊，还立志消灭匈奴。臣惭愧位列封王，尚且使胡人入侵不止，竟然令皇上议论想要迁都，这是我做臣下的责任。希望皇上听任臣报效一次微劳，攻取那个颉利。假若一两年内不将他捉住，慢慢商议迁都的策略，臣再不敢重说反对迁都。”高祖愤怒，仍旧派遣太宗率领三十多个骑兵巡行关中拟定铲平敌人之计划。太宗回军之日，坚决奏请不可迁都，高祖于是停止迁都。八年(625)，加太宗中书令。
九年(626)，皇太子建成、齐王元吉谋害太宗。六月四日，太宗率长孙无忌、尉迟敬德、房玄龄、杜如晦、宇文士及、高士廉、侯君集、程知节、秦叔宝、段志玄、屈突通、张士贵等在玄武门杀了建成、元吉。六月八日，太宗被立为皇太子，各种政务皆由太宗决断。太宗于是放掉宫廷花园中所养的鹰犬，并停止收取各方所进贡的奇珍异宝，政理崇尚简要严肃，天下人大喜。又命令百官各个呈上封章奏事，详细陈述安定人心治国的关键。十三日，命令道：“依照礼法，皇帝的两个名字不要为某一个字而避讳。近代以来，两个名字都避讳，废缺地方已经很多，任意避讳，有违经典。那些官号、人名、公私文籍图书，有‘世民’两个字不连续的，并不须要避讳。”撤销幽州大都督府。十五日，废除陕东道大行台，设置氵名州都督府；废除益州道行台，设置益州大都督府。二十六日，幽州大都督庐江王瑗图谋叛逆，废弃他为普通百姓。二十九日，撤销天策府。
七月六日，太子左庶子高士廉任侍中，右庶子房玄龄任中书令，尚书右仆射萧王禹为尚书左仆射，吏部尚书杨恭仁为雍州牧，太子左庶子长孙无忌为吏部尚书，右庶子杜如晦为兵部尚书，太子詹事宇文士及为中书令，封德彝为尚书右仆射。
八月八日，高祖传位给皇太子，太宗在东宫显德殿即位。派司空、魏国公裴寂在南郊烧柴祭天。大赦天下，武德元年(618)以来由于直言被责罚流放的人都放回来。文武官员五品以上先前无爵位者赐给爵位一级，六品以下加勋级一等。天下免赋税徭役一年。十八日，放宫廷宫女三千人回家。十九日，突厥颉利、突利入侵泾州。二十日，突厥入侵武功，京师戒严。二十一日，立妃子长孙氏为皇后。二十四日，突厥入侵高陵。二十六日，行军总管尉迟敬德与突厥在泾阳大战，大破突厥，斩首级一千多个。二十八日，突厥颉利到达渭水边，与颉利隔渭水对话，斥责他背弃定约。不久大军陆续到达，颉利见军容盛大威严，又知道执失思力被捕，由此大为恐惧，于是请求和解，诏令同意。太宗当天回宫。三十日，太宗又驾到便桥，与颉利杀白马而设盟誓，突厥带兵退走。
九月一日，颉利献马三千匹，羊一万口，太宗不受，命令颉利归还掳掠的中国人口。二十二日，太宗率领所有禁军步骑将领在显德殿殿廷学习射箭，对将军及其以下的官员说：“从古以来，突厥与中国互有盛衰。像轩辕善于使用五种兵器，就能北逐獯鬻；周宣王在方、召驱马驰骋，也能在太原取胜。到了汉、晋之君王，直到隋代，不让兵士平素练习干戈等兵器，突厥来侵犯，没有人能够抵御，致使中国百姓在敌寇手中处于极端困苦的处境。我现在不让你们挖池塘筑花园，建造所有过分糜费的东西，不让农民放纵安逸享乐，兵士只练习射箭骑马，期望使你们能够战斗，也期望你们前面没有强敌。”于是每天率领数百人在殿前教他们射箭，皇帝亲自面试，射中者随即赏赐弓刀、布匹绸缎。朝中有很多劝谏的臣子，他们说：“先王制度法令，有拿武器到皇帝处所的人处以刑法，用来在坏事尚未发生前就加以防止，这是防备意料不到的事。现在率领副将士卒一类的人，在皇宫殿前檐下平台及台阶上弯弓放箭，皇帝陛下却在旁边，正恐怕祸出意外，这不是用来为国家考虑的做法。”皇上不采纳。从此以后，士兵都成精锐部队。二十七日，诏令私人之家，不得擅权建立妖神，随意设立不适当的祭祀，不合礼法的祭祀祈祷，一概禁绝。除了龟甲兽骨五种占卜以外，其他杂七杂八的占卦卜卦，也都停止断绝使用。长孙无忌封为齐国公，房玄龄封为邢国公，尉迟敬德封为吴国公，杜如晦封为蔡国公，侯君集封为潞国公。
冬十一月一日，是朔日，有日蚀。八日，立中山王承乾为皇太子。十八日，裴寂食实际封户一千五百户。长孙无忌、王君廓、尉迟敬德、房玄龄、杜如晦食实封一千三百户。长孙顺德、柴绍、罗艺、赵郡王孝恭食实封一千二百户。侯君集、张公瑾、刘师立食实封一千户。李世责力、刘弘基食实封九百户。高士廉、宇文士及、秦叔宝、程知节食实封七百户。安兴贵、安修仁、唐俭、窦轨、屈突通、萧王禹、封德彝、刘义节食实封六百户。钱九陇、樊世兴、公孙武达、李孟常、段志玄、庞卿恽、张亮、李药师、杜淹、元仲文食实封四百户。张长逊、张平高、李安远、李子和、秦行师、马三宝食实封三百户。
十一月五日，宗室封为郡王者一律降封为县公。
十二月十九日，皇上亲自审查并记录囚徒罪状。
这一年，新罗、龟兹、突厥、高丽、百济、党项都派遣使者前来朝贡。
贞观元年(627)春正月一日，改元。十七日，燕郡王李艺占据泾州造反，不久被左右的人所杀，传送首级到京师示众。以仆射窦轨为益州大都督。
三月十日，皇后亲自养蚕。尚书左仆射、宋国公萧王禹为太子少师。二十三日，皇上下诏：“齐已故尚书仆射崔季舒、给事黄门侍郎郭遵、尚书右丞封孝琰等人，过去在邺中做官，名位显贵，心存忠诚正直，上表抗争极谏，设法挽救国家的危亡，却遭到像关龙逢一样的被囚禁杀害的酷刑。崔季舒之子崔刚、郭遵之子郭云、封孝琰之子封君遵，都因为家门遭到灾祸，高氏滥用刑法而受到株连。应该表扬奖励，特别与一般伦常关系不同，可以免除在宫廷侍候，而量才录用，另外议定官职。”
夏四月十二日，凉州都督、长乐王幼良被判死刑。
六月一日，尚书右仆射、密国公封德彝去世。十二日，太子少师宋国公萧王禹为尚书右仆射。
这年夏天，山东各州大旱灾，命令所在地赈济抚恤，不出今年田租赋税。
秋七月二日，吏部尚书、齐国公长孙无忌为尚书右仆射。
八月十九日，贬侍中、义兴郡公高士廉为安州大都督。户部尚书裴矩去世。这年，关东及河南陇右沿边疆各州遭霜危害秋季庄稼。
九月十二日，命中书侍郎温彦博、尚书右丞魏征等分头到各州赈济抚恤。中书令、郢国公宇文士及任殿中监。御史大夫、检校吏部尚书、参预朝政、安吉郡公杜淹可于姓名前加书官衔。
十二月四日，皇上对侍臣道：“神仙之事本虚假不实，空有其名。秦始皇特别爱好，于是被讲神仙方术的人所欺诈，竟派遣童男童女数千人随徐福入海求仙药，方术之士躲避秦朝严酷刑法，因而留海外不归。秦始皇还在海边徘徊等待仙药，回来到沙丘而病死。汉武帝为求仙，竟将女儿嫁给道术之人，事情既然无验证，便将道术之士杀掉。根据这两件事，神仙不须多加妄求。”尚书左仆射、宋国公萧王禹犯法免职。三十日，利州都督义安王孝常、右武卫将军刘德裕等人谋反，被判死刑。
这年，关中是荒年，以至于有卖儿女的。
贞观二年(628)春正月，尚书右仆射、齐国公长孙无忌为开府仪同三司。迁移改封汉王恪为蜀王，卫王泰为越王，楚王。。为燕王。再次设置六侍郎，副六尚书事，并设置左右司郎中各一人。前安州大都督、赵王元景为雍州牧，蜀王恪为益州大都督，越王泰为扬州大都督。
二月九日，。归附。
三月一日，是朔日，有日蚀。二十日，派遣御史大夫杜淹巡视关内各州。拿出后宫金银宝器，把出卖自己的男女赎还给他们的父母。二十三日，大赦天下。
夏四月三日，诏令凡是暴露的尸骨，命令所在地埋葬。二十日，契丹归附。首次诏令天下州县都设置义仓。夏州贼酋梁师都被其堂弟洛仁所杀，率城池归降。
五月，下大冰雹。
六月十五日，皇子李治出生，宴请五品以上官员，按品级等第赐给绸缎，又赏赐天下这一天出生的人以粟米。十六日，皇上对侍臣道：“君王即使不像君王，臣子不可以不像臣子。裴虔通是隋炀帝的左右侍从之臣，然而他亲自成为祸乱之首。朕正崇尚奖励忠孝仁义，岂可以仍使百姓顺应这种风俗。”诏命道“：天地定下君臣之位，君臣之道义因此表明；高低的地位既然已经陈述，人伦之道这才明确。因此风俗淳厚，教化天下。即使时常经过治和乱，君主有的昏庸有的英明，但疾风知劲草，留芳千古的忠臣不会断绝，剖心焚体，视死如归。难道他们不爱惜自己七尺之躯，不重视自己的性命？谅必是由于君臣义重，等级名分和礼教在前，故能在当时明白大节，在身后树立清名。至于赵高杀害秦二世，董卓鸩杀弘农王，人神所痛恨，不同朝代共同愤恨。况且凡庸俗小人，胸怀凶狠叛逆，闲暇时观看典籍，没有一个人不被诛杀。辰州刺史、长蛇县男裴虔通，过去在隋代，曾寄身于晋王手下，炀帝由于老臣之情，特加喜爱宠信。终于心无君上，暗中图谋杀害皇帝，窥探时机，招集一些叛逆，长矛飞箭，一朝暗中发动。天下之大恶如此，谁能加以容忍！本应消灭他的宗族，焚烧他的首级，以死刑向天下表明。但由于年代不同，累次遇到大赦之令，可以特别免除死刑，削除官职爵位，发配充军到。。州。”
秋七月四日，诏曰：“莱州刺史牛方裕、绛州刺史薛世良、广州都督府长史唐奉义、隋武牙郎将高元礼，都在隋朝受到重用，竟然勾结宇文化及，构成谋杀帝王之罪。应该依照处理裴虔通之法，削除官职爵位，发配充军到岭表。”太宗对侍奉之臣说“：天下愚昧之人，喜欢犯法，凡是大赦宽免的恩德，只是施及到遵守法律的人身上。古话说：‘小人的幸运，是君子的不幸。’‘一年赦免两次，好人会从此不再说话。’凡是培育恶草者伤害庄稼，给予犯法作乱的人以恩惠是危害好人。过去文王作刑法，施刑而不赦免。另外蜀先主刘备曾经对诸葛亮说‘：我在陈元方、郑康成之间交际应酬，常见他们谈及文启文告治与乱的办法很详备了，从不谈及大赦之事。’小人，是大人的危害，所以朕据有天下以来，不大发布大赦。现在四海平定，礼义兴起施行，特别的恩德，不可多次施行，如果多发布大赦，恐怕愚昧之人将会常常希望侥幸大赦，只想犯法，不能改过。”
八月一日，是朔日，皇上驾到朝堂，亲自鉴察冤屈。从此，皇上认为军国无事，每天到西宫侍候父母吃饭。二十日，公卿奏道“：依照礼制，夏季，皇上可以居住在台榭。现在盛暑未退，秋雨连绵开始，宫中低下潮湿，请兴建一个楼阁来居住。”皇上道：“朕有湿气之病，难道适宜住在低下潮湿之处。但假若同意公卿兴建楼阁的请求，耗费太多。过去汉文帝将兴建承露台，然而爱惜建台乃十家的产业而作罢。朕的德行不及汉文帝，然而所耗的费用超过了他，难道能说这是做人民父母的思想吗？”终究不允许。这月，河南、河北大霜冻，人们遭遇大饥荒。
九月四日，皇上对侍臣道：“妇人关闭在深宫，情况实在可怜。隋朝末年，采求宫女不止，至于离宫别馆，不是皇帝驾到之地，多多聚集宫人妇女，都竭尽了人力财力，是朕所不取的。再说她们除洒扫宫庭之外，还有什么用处？现在将她们放出，任凭她们选择配偶，这不仅仅是怕浪费，也是让这些妇女满足各人的性格追求。”于是派尚书左丞戴胄、给事中杜正伦等，在掖庭宫西门挑选后遣送出去。
冬十月七日，御史大夫、安吉郡公杜淹去世。十五日，杀瀛州刺史卢祖尚。
十一月十九日，在圆丘有事。
十二月十日，黄门侍郎王王圭为侍中。
三年(629)春正月九日，契丹大帅来朝见。十六日，晋谒太庙。二十一日，皇上亲自耕种征用民用耕种的田。二十九日，司空、魏国公裴寂犯法免官。
二月六日，中书令、邢国公房玄龄为尚书左仆射，兵部尚书、检校侍中、蔡国公杜如晦为尚书右仆射，刑部尚书、检校中书令、永康县公李靖为兵部尚书，尚书右丞魏征试用为秘书监，参预朝政。
夏四月十日，太上皇迁居大安宫。二十三日，太宗开始在太极殿听政。
五月，周王元方去世。
六月八日，因为干旱，皇上亲自审查并记录囚徒罪状。派遣长孙无忌、房玄龄等人在名山大川求雨，中书舍人杜正伦等人往关内各州安抚慰问。又命令文武官员各人上密封的奏章，尽量说出朝政得失。九日，大风吹断了树木。秋八月一日，是朔日，有日蚀。薛延陀派使者前来朝贡。
九月十六日，各州设置医学。
冬十一月九日，西突厥、高昌派使者前来朝贡。二十二日，以并州都督李世责力为通汉道行军总管，兵部尚书李靖为定襄道行军总管，以打击突厥。
十二月二日，突利可汗奔来归附。十七日，杜如晦因病辞去官位，太宗同意。闰十二月十七日，诏令建立义军以来交兵之处，替义士勇夫在阵战中牺牲者各建立一座寺庙。命令虞世南、李伯药、褚亮、颜师古、岑文本、许敬宗、朱子奢等人为他们立碑刻铭文，以记载他们的功业。
这年，户部奏称：中国人从塞外归来及突厥前前后后归附、开辟四边少数民族地区为州县的地方，男女有一百二十余万人口。